Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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