Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Ndst2-205ENSMUST00000225000 3661 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm8362-201ENSMUST00000168790 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Siglech-202ENSMUST00000094360 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpusd2Q149F1 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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