Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Top2aQ01320 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Top2aQ01320 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Top2aQ01320 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Top2aQ01320 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms