Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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