Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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RxraP28700 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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RxraP28700 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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RxraP28700 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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