Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RhoP15409 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
RhoP15409 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RhoP15409 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
RhoP15409 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
RhoP15409 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RhoP15409 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RhoP15409 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RhoP15409 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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