Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Cyp2c37-201ENSMUST00000049178 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Etfdh-202ENSMUST00000120992 2233 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Pign-210ENSMUST00000190811 3015 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Nek10-202ENSMUST00000112630 3348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Grip1-204ENSMUST00000105261 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Zscan22-202ENSMUST00000117189 2995 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm16121-201ENSMUST00000128520 2253 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Selenop-203ENSMUST00000159216 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Hp1bp3-203ENSMUST00000105825 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm12003-201ENSMUST00000118518 1105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm11440-201ENSMUST00000121509 527 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm12864-201ENSMUST00000122207 1006 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm15585-201ENSMUST00000149696 670 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm37282-201ENSMUST00000191987 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm37665-201ENSMUST00000192353 149 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm43835-201ENSMUST00000195932 149 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm43535-201ENSMUST00000197846 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm44379-201ENSMUST00000204501 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm44268-201ENSMUST00000204814 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 4833412C05Rik-202ENSMUST00000208257 850 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Fgfbp1-201ENSMUST00000061299 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Gm22362-201ENSMUST00000083102 134 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd3P09027 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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