Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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