Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20830J3KML6 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms