Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms