Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Rnf4Q9QZS2 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Rnf4Q9QZS2 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Rnf4Q9QZS2 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Rnf4Q9QZS2 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Rnf4Q9QZS2 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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