Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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OtofQ9ESF1 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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OtofQ9ESF1 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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OtofQ9ESF1 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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OtofQ9ESF1 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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OtofQ9ESF1 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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OtofQ9ESF1 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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