Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms