Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Khdc3Q9CWU5 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Khdc3Q9CWU5 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms