Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms