Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ccdc38Q8CDN8 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ccdc38Q8CDN8 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ccdc38Q8CDN8 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ccdc38Q8CDN8 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ccdc38Q8CDN8 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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