Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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