Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccdc18Q640L5 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccdc18Q640L5 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccdc18Q640L5 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccdc18Q640L5 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccdc18Q640L5 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccdc18Q640L5 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccdc18Q640L5 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccdc18Q640L5 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ccdc18Q640L5 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ccdc18Q640L5 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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