Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PcolceQ61398 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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