Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Mir7655-201ENSMUST00000183376 58 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm28477-201ENSMUST00000188125 406 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm9322-201ENSMUST00000188144 958 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm44233-201ENSMUST00000203616 226 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Cavin2-201ENSMUST00000051572 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm37354-201ENSMUST00000193333 2384 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 4632432E15Rik-201ENSMUST00000191824 2439 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm26597-201ENSMUST00000181648 1477 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gabpb2-203ENSMUST00000107204 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm28095-201ENSMUST00000186343 1515 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Sag-209ENSMUST00000177757 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC164437.2-202ENSMUST00000227367 1639 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 C330002G04Rik-201ENSMUST00000181623 2054 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Prune2-207ENSMUST00000225351 2115 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Pus10-202ENSMUST00000058163 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr324-202ENSMUST00000214990 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr718-ps1-201ENSMUST00000164536 3962 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms