Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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