Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Kcnj10-201ENSMUST00000056136 5407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Recql-203ENSMUST00000111803 3389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 1700112J16Rik-201ENSMUST00000181631 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Klhl28-201ENSMUST00000021331 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Mavs-201ENSMUST00000041362 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Bag3-201ENSMUST00000033136 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Fmo5-201ENSMUST00000029729 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Sun1-206ENSMUST00000110884 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Itgb2l-201ENSMUST00000000161 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Hacl1-201ENSMUST00000022437 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Rnf122-201ENSMUST00000046941 3582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ankrd6-205ENSMUST00000108166 2321 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm45213-201ENSMUST00000206065 304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Zc3hav1-204ENSMUST00000143702 3364 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Nlrp14-202ENSMUST00000142623 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Chat-201ENSMUST00000070125 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Nrxn3-203ENSMUST00000110133 2699 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Vill-201ENSMUST00000051386 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ncaph2-201ENSMUST00000036987 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Zfp408-201ENSMUST00000099714 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ctrcos-201ENSMUST00000128368 322 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm20319-201ENSMUST00000172522 771 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm20686-201ENSMUST00000175846 535 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Smok3b-201ENSMUST00000100537 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Zmiz2-203ENSMUST00000109785 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms