Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pde1bQ01065 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pde1bQ01065 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pde1bQ01065 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pde1bQ01065 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pde1bQ01065 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Pde1bQ01065 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Pde1bQ01065 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Pde1bQ01065 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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Pde1bQ01065 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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