Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms