Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms