Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VdrP48281 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VdrP48281 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VdrP48281 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VdrP48281 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VdrP48281 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VdrP48281 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VdrP48281 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VdrP48281 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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VdrP48281 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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VdrP48281 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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VdrP48281 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VdrP48281 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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