Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms