Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms