Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms