Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P20040 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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