Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC133183.2-201ENSMUST00000221543 280 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Fgfbp1-201ENSMUST00000061299 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PdgfaP20033 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PdgfaP20033 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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PdgfaP20033 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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PdgfaP20033 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PdgfaP20033 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PdgfaP20033 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms