Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms