Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Atf6bO35451 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atf6bO35451 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms