Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms