Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Usp9yF8VPU6 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms