Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms