Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms