Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms