Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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