Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
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