Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms