Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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