Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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