Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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