Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Irx1P81068 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Irx1P81068 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Irx1P81068 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Irx1P81068 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Irx1P81068 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Irx1P81068 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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Irx1P81068 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Irx1P81068 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Irx1P81068 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms