Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd13P70217 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd13P70217 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms