Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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NcstnP57716 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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NcstnP57716 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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NcstnP57716 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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NcstnP57716 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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NcstnP57716 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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NcstnP57716 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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NcstnP57716 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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NcstnP57716 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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NcstnP57716 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcstnP57716 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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