Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Cldn18P56857 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cldn18P56857 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cldn18P56857 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cldn18P56857 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cldn18P56857 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cldn18P56857 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cldn18P56857 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn18P56857 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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