Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp4P35123 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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