Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxc11P31313 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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